自2002年X档案的六年后，前联邦探员丹娜·斯科莉（吉莲·安德森 Gillian Anderson 饰）调任某教会医院担任医师，福克斯·穆德（大卫·杜楚尼 David Duchovny 饰）则过着隐居的生活，继续着对超自然现象的关注。某天，FBI探员前来请求他们的帮助。原来一段时间内，维吉尼亚州接连有数名女子神秘失踪，其中甚至包括一名联邦探员。由于神父约瑟夫（Billy Connolly 饰）声称看到了犯罪画面，因此FBI希望对超自然案件有着丰富经验的穆德和斯科莉协助调查。然而随着调查的深入，穆德和斯科莉却发现案件的黑暗远远超出他们的想象。这对合作多年的搭档面临着巨大的考验……本片为同名美剧的第二部剧场版。
未来，随着科技的不断进步，人类医学也达到前所未有的高度。当你某个器官患有疾病时，不用担心自己会死于非命，也不必苦苦等待遥遥无期的捐赠器官，只要移植人造器官即可回归正常的生活。当然，天下没有免费的午餐，全新的器官伴随着高昂的购买金，受移植者一旦无法承担这笔费用，将面临被杀害并被夺走器官的悲惨命运。雷米（裘德·洛 Jude Law 饰）隶属这家销售器官的联盟公司，他的工作是追杀那些拖延还款的客人。凭借这份冷酷无情的工作，他过着养尊处优的生活。然而厄运突然降临，他因重病移植了联盟的人造心脏，更因无法偿还款项而遭
Mike Regan拥有他想要的一切：美满的家庭，一栋顶级的全智能别墅，而他的公司则将彻底改变航空业。直到他信赖的IT guy因为Regan一家的冷落而失去理智，开始跟踪他的女儿，监视他的生活，往日依赖的全智能家居和汽车系统如今成为最大的安全隐患。随着隐私的全面暴露，Regan一家陷入前所未有的恐慌，一场个人隐私和现代科技的博弈就此展开……
